《反恐精英：生化危机》的故事情节主要围绕生化病毒的泄露和由此引发的全球生化危机展开。以下是对故事情节的详细解析：
起源
故事开始于20世纪初的一个偏远村庄，一个神秘的宗教团体在地下秘密举行集会。
该宗教团体的成员被残忍谋杀后，尸体与水源长期浸泡，导致微生物和尸体发生突变，最终复活成为丧尸。
生化危机的爆发
21世纪，T阵营在全球范围内肆虐，联合政府为了对抗T阵营，启动了超级战士计划。
T阵营得知了联合政府运送生化病毒到72街仓库的消息，并挟持了人质。
军方通过管道突入仓库，成功营救了人质，但T阵营的人被全部消灭。
生化幽灵的诞生
研究小组在研究所里夜以继日地进行封闭性测试，创造出了强大的“生化幽灵”。
这些“生化幽灵”因服用催化药剂而具有生化感染的特性，能够感染并转化周围的生物。
撤离与求生
安德烈·佛朗西斯率领的小队通过C楼与幸存者会合，但遭到僵尸的重重包围。
队员们一路杀到研究所楼顶，最终通过下水道撤离，但过程中不少队员被感染变成僵尸。
联合对抗
生还的研究员决定废弃研究结果，并请军事专家建议，最终决定由“保卫者”和“潜伏者”联合起来制服“生化幽灵”。
后续行动
在蓝白海湾，一支特殊作战部队被调集前往镇压生化危机。
部队在强大的火力面前逐个击破生化僵尸，但危机即将解除时，出现了新的问题。
个人英雄主义
幻影，一个普通女生，在生化危机中凭借过人的身手解决了不少敌人，但最终被武装人员抓走。
幻影在基地里找到作战服，逃脱并加入救世主带领的搜救部队，但最终被生化幽灵感染变异。
超级战士的复活
雷克斯博士在研究所研究生化兵器时，T阵营的人炸毁了研究所，导致雷克斯博士死亡。
雷克斯博士的尸体与爆弹兽颅融合，他因此感染病毒复活，并可以直接从身体上取出爆弹兽颅。
总的来说，《反恐精英：生化危机》的故事情节是一个充满紧张和刺激的生化末日故事，涉及多个角色和复杂的情节发展，最终由“保卫者”和“潜伏者”联合起来对抗强大的生化幽灵，揭示了一个关于病毒、突变和生存的故事。
